لایسنس ها مجوزهایی هستند که بنا بر مشخصات سخت افزاری روتربردها و امکان پشتیبانی از تعداد کلاینت های User Manager و یا کلاینت هایی که از انواع تانلها استفاده می کنند تعریف می شوند و بر اساس نوع آنها، امکاناتی را به RouterOS در روتربردهای میکروتیک می دهد.به طور کلی لایسنس ها در 4 سطح 3، 4، 5 و 6 ارائه می شوند و هرکدام از این Level ها امکان پشتیبانی از مقدار معینی کلاینت دارند. به عنوان نمونه کلاینت های User Manager با توجه به سطح لایسنس در Level 4 از 20 کلاینت، Level 5 از 50 کلاینت، 3 Level از 10 کلاینت و در Level 6 از نا محدود کلاینت پشتیبانی می کند. بنابراین می توان نتیجه گرفت که میزان پشتیبانی از کلاینت های User Manager ارتباطی به تعداد کلاینت های ثبت شده در شبکه نداشته و بستگی به Level لایسنس مورد استفاده، دارد. به همین ترتیب تعداد کلاینت های Hotspot ،PPPOE ،PPTP ،L2TP و O********* با توجه به Level لایسنس مشخص می شود. تنها لایسنس Level 6 امکان پشتیبانی از تمامی کلاینت های PPPOE ،PPTP ،L2TP ،O********* ،Hotspot و User Manager را به صورت نامحدود دارا می باشد.
جدول مقايسه اي میان لایسنس های لایه 3 تا 6 میکروتیک
| Level number | 0 (Trial mode) | 1 (Free Demo) | 3 (WISP CPE) | 4 (WISP) | 5 (WISP) | 6 (Controller) |
| Price | no key | registration required | volume only | $45 | $95 | $250 |
| Initial Config Support | – | – | – | 15 days | 30 days | 30 days |
| Wireless AP | 24h trial | – | – | yes | yes | yes |
| Wireless Client and Bridge | 24h trial | – | yes | yes | yes | yes |
| RIP, OSPF, BGP protocols | 24h trial | – | yes(*) | yes | yes | yes |
| EoIP tunnels | 24h trial | 1 | unlimited | unlimited | unlimited | unlimited |
| PPPoE tunnels | 24h trial | 1 | 200 | 200 | 500 | unlimited |
| PPTP tunnels | 24h trial | 1 | 200 | 200 | 500 | unlimited |
| L2TP tunnels | 24h trial | 1 | 200 | 200 | 500 | unlimited |
| O********* tunnels | 24h trial | 1 | 200 | 200 | unlimited | unlimited |
| VLAN interfaces | 24h trial | 1 | unlimited | unlimited | unlimited | unlimited |
| HotSpot active users | 24h trial | 1 | 1 | 200 | 500 | unlimited |
| RADIUS client | 24h trial | – | yes | yes | yes | yes |
| Queues | 24h trial | 1 | unlimited | unlimited | unlimited | unlimited |
| Web proxy | 24h trial | – | yes | yes | yes | yes |
| User manager active sessions | 24h trial | 1 | 10 | 20 | 50 | Unlimited |
| Number of KVM guests | none | 1 | Unlimited | Unlimited | Unlimited | Unlimited |